□ 정수영 교수 연구실 (뇌·인지과학부/인공지능학과)에서 일주기성 전사체 분석 파이프라인 구축을 도와줄 학부 연구생을 모집합니다.

 ○ 대상자: 이화여대 학부생으로서 R 프로그래밍 능통자

 ○ 연구분야 소개

 • 일주기 생체리듬(Circadian rhythm)은 하루를 주기로 나타나는 생물학적 리듬을 의미하며, 단일 세포 수준에서 유전자 발현의 일주기적 오르내림이 근간임 

 • 따라서 RNA 시퀀싱으로 대표되는 전사체 빅데이터와 생물정보학적 분석 기법을 이용한 일주기적 전사체 발현 분석(Circadian transcriptome profiling)은 일주기적인 생리, 대사, 행동의 분자생물학적 기전연구를 위한 핵심 연구전략으로 각광받고 있음

 • 이에 따라 전사체 데이터로부터 일주기적 특성을 도출하고, 이를 비교·분석하는 다양한 분석 알고리듬이 개발됨

 • 본 연구실은 고려대 의과대학 및 경북대 약학대학과의 공동연구를 통해 주요 뇌 기능의 일주기적 조절 기전을 규명하고, 이를 제어하는 약리학적 전략을 개발하고 있음

 ○ 주요 업무내용

 • 논문을 통해 R 기반 소스 코드가 공개된 주요 분석 알고리듬을 조합하여, 일관 분석 파이프라인을 구축

 • 분석 파이프라인 구축 과정에서 예시 데이터세트를 이용한 오류 검증

 • R 사용 초심자를 고려한 UI 고안 및 사용자 교육

 ○ 파이프라인 구축에 사용될 주요 알고리듬 예시

 • CYCLOPS (Anafi et al., 2017, Proc Natl Acad Sci USA 114(20):5312-5317.)

 • SkinPhaser (Wu et al., 2020, Genome Med 12(1):73.)

 • MetaCycle (Wu et al., 2016, Bioinformatics 32(21):3351-3353.)

 • PSEA (Zhang et al., 2016, J Biol Rhythms 31(3):244-257.)

 ※ 상기 핵심 알고리듬과 함께 분석 파이프라인 운용을 위해 필요한 통계 알고리듬이 일부 추가될 수 있으며, 개선된 최신 알고리듬으로 대체할 수 있음 

 ※ 비선형 회귀분석 및 기계학습 관련 배경지식이 분석 내역 이해에 도움이 될 수 있음 

 ○ 근무기간 및 조건

 • 2023년 8월 혹은 9월부터 4개월(협의 후 기간 조정 가능)

 • 근무 형태: 재택 근무(주로 이메일 교신) + 주 1회 대면회의

 • 인건비: 국책과제 연구생 등록을 통해 60만원/월 지급

 ※ 본인이 원할 경우 실험실로 출근할 수 있으나, 주 1회 대면회의 외에는 출근 의무 없음

 ○ 문의 및 지원

 • 정수영 (csooy@ewha.ac.kr)

 • 지원서류: 성적증명서 및 CV