식품은 많은 유용한 물질을 함유하고 있으며 이들은 각기 다른 원인으로 생리적 활성을 가진다. 식품 생리활성물질을 실제 질병의 예방과 치료에 적용하기 위해서는 이들이 작용하는 근거를 밝히는 것이 매우 중요하다. 동일한 질환이라도 환자마다 질환이 발생하는 원인이 다르므로 이러한 차이를 반영하여 환자에 따른 맞춤 치료방법을 모색하는 측면에서도 식품 생리활성물질들이 작용하는 근본 이유에 대한 정보가 중요하며 이에 따라 특정 생리활성물질의 사용에 유익할 수 있는 환자를 구별해 낼 수 있다.
약물 치료제의 발달로 만성질환 치료에 큰 발전을 이루었음에도 현재 사용되고 있는 치료제들은 여전히 약제내성 등의 부작용을 가지고 있다. 식품 생리활성물질과 약물 치료제의 상호작용 및 이들의 병용에 의한 치료 유효성 연구는 이들의 병용요법으로 치료를 향상시킬 수 있는 근거를 제공한다.
식품성분 및 첨가물의 안전성 평가는 관련제품의 활용에 있어서 매우 중요한 요소이다. 독성평가, 섭취량 추정을 통해 식품감미료 등 식품성분 및 첨가물의 유용성과 위해성 평가를 수행하고 있다.